Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms