Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms