Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KDELR1P24390 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KDELR1P24390 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms