Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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