Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms