Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms