Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUP10909 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUP10909 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms