Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA8P0DM63 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms