Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms