Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF3P09919 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms