Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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