Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13BP05160 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13BP05160 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13BP05160 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F13BP05160 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms