Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms