Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms