Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms