Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms