Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA4O75335 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms