Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms