Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms