Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms