Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms