Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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