Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNMO15061 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms