Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRTO14522 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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