Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB9F8W1W9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms