Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms