Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms