Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A8MVJ9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A8MVJ9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A8MVJ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A8MVJ9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms