Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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