Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP3Q9Y6F1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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