Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms