Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG4BQ9Y4P1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms