Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG6Q9Y2V7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms