Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms