Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms