Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms