Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF346Q9UL40 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF346Q9UL40 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms