Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMD1Q9UGP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms