Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms