Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms