Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms