Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APEX2Q9UBZ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms