Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RNF7Q9UBF6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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