Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms