Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms