Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms