Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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