Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms