Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms