Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms